L'OSU-Réunion n'exerce aucune responsabilité directe sur la gestion des masters à l'Université de la Réunion. Ces diplômes relèvent de l'UFR Sciences et Technologies. Néanmoins ces masters on été proposés à l'initiative de membres des laboratoires rattachés à l'OSU et de nombreux enseignants sont issus de ces laboratoires, lesquels accueillent en stage d'initiation à la recherche à la fois les étudiants de M1 et de M2. Certains M2, notamment du Master Geosphère, sont conduits en partenariat avec des universités extérieures : Métropole et Madagascar.
| Intitulé du master | Laboratoire partenaire | Responsable | Informations | Partenariats |
| GEOSPHERE | LACy LGSR | Hassan Bencherif | Pdf maquette à télécharger | Master magmas et Volcans, UBP Clermont Ferrand, Master transferts sols et aquifères, Université d'Avignon, Master Océan Atmosphère Continent, UPS Toulouse |
| BEST (Biodiversité et Ecosystèmes tropicaux) | ECOMAR PVBMT | Matthieu Lecorre | sites.univ-reunion.fr/best/ |
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| M2 Physique-Chimie, Enseignement | LACy PIMENT | Maurice Aknin | PDF Maquette à télécharger |
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